Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r48Q9EQ52 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r48Q9EQ52 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r48Q9EQ52 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vmn1r48Q9EQ52 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r48Q9EQ52 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r48Q9EQ52 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Vmn1r48Q9EQ52 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms