Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp1bQ9EPL6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp1bQ9EPL6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp1bQ9EPL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp1bQ9EPL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mmp1bQ9EPL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mmp1bQ9EPL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mmp1bQ9EPL6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mmp1bQ9EPL6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mmp1bQ9EPL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms