Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ap3s1Q9DCR2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3s1Q9DCR2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3s1Q9DCR2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ap3s1Q9DCR2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3s1Q9DCR2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ap3s1Q9DCR2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap3s1Q9DCR2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap3s1Q9DCR2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms