Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmg20aQ9DC33 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20aQ9DC33 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20aQ9DC33 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hmg20aQ9DC33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20aQ9DC33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hmg20aQ9DC33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hmg20aQ9DC33 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hmg20aQ9DC33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20aQ9DC33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms