Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC29

Abcb6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb6Q9DC29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcb6Q9DC29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcb6Q9DC29 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcb6Q9DC29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcb6Q9DC29 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcb6Q9DC29 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcb6Q9DC29 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcb6Q9DC29 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcb6Q9DC29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcb6Q9DC29 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcb6Q9DC29 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcb6Q9DC29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Abcb6Q9DC29 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcb6Q9DC29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Abcb6Q9DC29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Abcb6Q9DC29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Abcb6Q9DC29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Abcb6Q9DC29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcb6Q9DC29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcb6Q9DC29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcb6Q9DC29 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcb6Q9DC29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcb6Q9DC29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcb6Q9DC29 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcb6Q9DC29 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcb6Q9DC29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms