Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cyp27a1Q9DBG1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Cyp27a1Q9DBG1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Cyp27a1Q9DBG1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Cyp27a1Q9DBG1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cyp27a1Q9DBG1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Cyp27a1Q9DBG1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cyp27a1Q9DBG1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cyp27a1Q9DBG1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Cyp27a1Q9DBG1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Cyp27a1Q9DBG1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cyp27a1Q9DBG1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cyp27a1Q9DBG1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cyp27a1Q9DBG1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cyp27a1Q9DBG1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Cyp27a1Q9DBG1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cyp27a1Q9DBG1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cyp27a1Q9DBG1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Cyp27a1Q9DBG1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,1 ms