Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ftsj3Q9DBE9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ftsj3Q9DBE9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ftsj3Q9DBE9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ftsj3Q9DBE9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ftsj3Q9DBE9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ftsj3Q9DBE9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ftsj3Q9DBE9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ftsj3Q9DBE9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ftsj3Q9DBE9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ftsj3Q9DBE9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ftsj3Q9DBE9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ftsj3Q9DBE9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ftsj3Q9DBE9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ftsj3Q9DBE9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ftsj3Q9DBE9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ftsj3Q9DBE9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ftsj3Q9DBE9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ftsj3Q9DBE9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ftsj3Q9DBE9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ftsj3Q9DBE9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ftsj3Q9DBE9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ftsj3Q9DBE9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ftsj3Q9DBE9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ftsj3Q9DBE9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ftsj3Q9DBE9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ftsj3Q9DBE9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ftsj3Q9DBE9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ftsj3Q9DBE9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ftsj3Q9DBE9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms