Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5oQ9DB20 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5oQ9DB20 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5oQ9DB20 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5oQ9DB20 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp5oQ9DB20 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp5oQ9DB20 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp5oQ9DB20 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp5oQ9DB20 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp5oQ9DB20 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp5oQ9DB20 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp5oQ9DB20 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp5oQ9DB20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atp5oQ9DB20 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms