Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Phf7Q9DAG9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Phf7Q9DAG9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Phf7Q9DAG9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phf7Q9DAG9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phf7Q9DAG9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf7Q9DAG9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phf7Q9DAG9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phf7Q9DAG9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Phf7Q9DAG9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf7Q9DAG9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf7Q9DAG9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf7Q9DAG9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf7Q9DAG9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms