Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc89Q9DA73 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc89Q9DA73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc89Q9DA73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc89Q9DA73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc89Q9DA73 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc89Q9DA73 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc89Q9DA73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc89Q9DA73 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc89Q9DA73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc89Q9DA73 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc89Q9DA73 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc89Q9DA73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc89Q9DA73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc89Q9DA73 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc89Q9DA73 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc89Q9DA73 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc89Q9DA73 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms