Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldnd2Q9D9H2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cldnd2Q9D9H2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldnd2Q9D9H2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldnd2Q9D9H2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cldnd2Q9D9H2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cldnd2Q9D9H2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldnd2Q9D9H2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cldnd2Q9D9H2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms