Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem41aQ9D8U2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem41aQ9D8U2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem41aQ9D8U2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem41aQ9D8U2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem41aQ9D8U2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem41aQ9D8U2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms