Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Derl3Q9D8K3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Derl3Q9D8K3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Derl3Q9D8K3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Derl3Q9D8K3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Derl3Q9D8K3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Derl3Q9D8K3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Derl3Q9D8K3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Derl3Q9D8K3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Derl3Q9D8K3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Derl3Q9D8K3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Derl3Q9D8K3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Derl3Q9D8K3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Derl3Q9D8K3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms