Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfrsf13cQ9D8D0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfrsf13cQ9D8D0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnfrsf13cQ9D8D0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf13cQ9D8D0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms