Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Timm50Q9D880 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Timm50Q9D880 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Timm50Q9D880 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Timm50Q9D880 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Timm50Q9D880 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Timm50Q9D880 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Timm50Q9D880 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Timm50Q9D880 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Timm50Q9D880 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Timm50Q9D880 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Timm50Q9D880 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Timm50Q9D880 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timm50Q9D880 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms