Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cyp2c55Q9D816 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cyp2c55Q9D816 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cyp2c55Q9D816 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cyp2c55Q9D816 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cyp2c55Q9D816 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cyp2c55Q9D816 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cyp2c55Q9D816 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cyp2c55Q9D816 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyp2c55Q9D816 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyp2c55Q9D816 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms