Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nop56Q9D6Z1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nop56Q9D6Z1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nop56Q9D6Z1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nop56Q9D6Z1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop56Q9D6Z1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nop56Q9D6Z1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop56Q9D6Z1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nop56Q9D6Z1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nop56Q9D6Z1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nop56Q9D6Z1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nop56Q9D6Z1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nop56Q9D6Z1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nop56Q9D6Z1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop56Q9D6Z1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop56Q9D6Z1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms