Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tubb4aQ9D6F9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubb4aQ9D6F9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubb4aQ9D6F9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubb4aQ9D6F9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tubb4aQ9D6F9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tubb4aQ9D6F9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb4aQ9D6F9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb4aQ9D6F9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tubb4aQ9D6F9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms