Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Speer4f1Q9D5Q6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Speer4f1Q9D5Q6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Speer4f1Q9D5Q6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Speer4f1Q9D5Q6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Speer4f1Q9D5Q6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Speer4f1Q9D5Q6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Speer4f1Q9D5Q6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Speer4f1Q9D5Q6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Speer4f1Q9D5Q6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Speer4f1Q9D5Q6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Speer4f1Q9D5Q6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Speer4f1Q9D5Q6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Speer4f1Q9D5Q6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Speer4f1Q9D5Q6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Speer4f1Q9D5Q6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Speer4f1Q9D5Q6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Speer4f1Q9D5Q6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Speer4f1Q9D5Q6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms