Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
ShpkQ9D5J6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,96
ShpkQ9D5J6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
ShpkQ9D5J6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
ShpkQ9D5J6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
ShpkQ9D5J6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,06■□□□□ 0,96
ShpkQ9D5J6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
ShpkQ9D5J6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,01■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
ShpkQ9D5J6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20,91■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
ShpkQ9D5J6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20,88■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
ShpkQ9D5J6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20,81■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
ShpkQ9D5J6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,76■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20,72■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,71■□□□□ 0,91
ShpkQ9D5J6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20,68■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
ShpkQ9D5J6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
ShpkQ9D5J6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
ShpkQ9D5J6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
ShpkQ9D5J6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms