Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sf3a3Q9D554 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sf3a3Q9D554 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sf3a3Q9D554 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sf3a3Q9D554 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sf3a3Q9D554 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sf3a3Q9D554 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sf3a3Q9D554 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3a3Q9D554 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms