Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ankrd39Q9D2X0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ankrd39Q9D2X0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ankrd39Q9D2X0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ankrd39Q9D2X0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ankrd39Q9D2X0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ankrd39Q9D2X0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms