Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps33aQ9D2N9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps33aQ9D2N9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps33aQ9D2N9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps33aQ9D2N9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps33aQ9D2N9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps33aQ9D2N9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vps33aQ9D2N9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps33aQ9D2N9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps33aQ9D2N9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps33aQ9D2N9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps33aQ9D2N9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vps33aQ9D2N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps33aQ9D2N9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps33aQ9D2N9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps33aQ9D2N9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps33aQ9D2N9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms