Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Syf2Q9D198 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syf2Q9D198 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syf2Q9D198 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Syf2Q9D198 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Syf2Q9D198 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Syf2Q9D198 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Syf2Q9D198 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Syf2Q9D198 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Syf2Q9D198 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Syf2Q9D198 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms