Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Susd3Q9D176 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Susd3Q9D176 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26,93■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Susd3Q9D176 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Susd3Q9D176 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Susd3Q9D176 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Susd3Q9D176 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Susd3Q9D176 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Susd3Q9D176 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Susd3Q9D176 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Susd3Q9D176 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Susd3Q9D176 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Susd3Q9D176 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Susd3Q9D176 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Susd3Q9D176 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Susd3Q9D176 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Susd3Q9D176 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Susd3Q9D176 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms