Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem88Q9D0N8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem88Q9D0N8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tmem88Q9D0N8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem88Q9D0N8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tmem88Q9D0N8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmem88Q9D0N8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem88Q9D0N8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms