Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc7Q9D0M0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc7Q9D0M0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc7Q9D0M0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc7Q9D0M0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc7Q9D0M0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc7Q9D0M0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Exosc7Q9D0M0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc7Q9D0M0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exosc7Q9D0M0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Exosc7Q9D0M0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exosc7Q9D0M0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc7Q9D0M0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Exosc7Q9D0M0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exosc7Q9D0M0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Exosc7Q9D0M0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exosc7Q9D0M0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Exosc7Q9D0M0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Exosc7Q9D0M0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Exosc7Q9D0M0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms