Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Mms19Q9D071 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Mms19Q9D071 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mms19Q9D071 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mms19Q9D071 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mms19Q9D071 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mms19Q9D071 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mms19Q9D071 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mms19Q9D071 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mms19Q9D071 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mms19Q9D071 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mms19Q9D071 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mms19Q9D071 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mms19Q9D071 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Mms19Q9D071 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mms19Q9D071 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mms19Q9D071 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mms19Q9D071 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mms19Q9D071 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mms19Q9D071 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mms19Q9D071 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mms19Q9D071 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mms19Q9D071 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms