Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf146Q9CZW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf146Q9CZW6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Rnf146Q9CZW6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf146Q9CZW6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf146Q9CZW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf146Q9CZW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf146Q9CZW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rnf146Q9CZW6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf146Q9CZW6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf146Q9CZW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf146Q9CZW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms