Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ssbp1Q9CYR0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ssbp1Q9CYR0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssbp1Q9CYR0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssbp1Q9CYR0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssbp1Q9CYR0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssbp1Q9CYR0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp1Q9CYR0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms