Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcfc1r1Q9CYQ5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcfc1r1Q9CYQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms