Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gins3Q9CY94 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gins3Q9CY94 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gins3Q9CY94 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gins3Q9CY94 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gins3Q9CY94 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gins3Q9CY94 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gins3Q9CY94 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gins3Q9CY94 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gins3Q9CY94 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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