Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ube2fQ9CY34 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ube2fQ9CY34 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube2fQ9CY34 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube2fQ9CY34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ube2fQ9CY34 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ube2fQ9CY34 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ube2fQ9CY34 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2fQ9CY34 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2fQ9CY34 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms