Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem50aQ9CXL1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem50aQ9CXL1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem50aQ9CXL1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem50aQ9CXL1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem50aQ9CXL1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem50aQ9CXL1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem50aQ9CXL1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem50aQ9CXL1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem50aQ9CXL1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem50aQ9CXL1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem50aQ9CXL1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem50aQ9CXL1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem50aQ9CXL1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem50aQ9CXL1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem50aQ9CXL1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem50aQ9CXL1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem50aQ9CXL1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem50aQ9CXL1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms