Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psmd8Q9CX56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmd8Q9CX56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psmd8Q9CX56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd8Q9CX56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Psmd8Q9CX56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psmd8Q9CX56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psmd8Q9CX56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psmd8Q9CX56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psmd8Q9CX56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psmd8Q9CX56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psmd8Q9CX56 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmd8Q9CX56 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmd8Q9CX56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms