Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Yif1bQ9CX30 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Yif1bQ9CX30 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Yif1bQ9CX30 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Yif1bQ9CX30 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Yif1bQ9CX30 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Yif1bQ9CX30 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yif1bQ9CX30 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Yif1bQ9CX30 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Yif1bQ9CX30 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Yif1bQ9CX30 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Yif1bQ9CX30 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Yif1bQ9CX30 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Yif1bQ9CX30 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Yif1bQ9CX30 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Yif1bQ9CX30 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms