Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Malsu1Q9CWV0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Malsu1Q9CWV0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Malsu1Q9CWV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Malsu1Q9CWV0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Malsu1Q9CWV0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Malsu1Q9CWV0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Malsu1Q9CWV0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms