Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Snx10Q9CWT3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snx10Q9CWT3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Snx10Q9CWT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx10Q9CWT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx10Q9CWT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx10Q9CWT3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx10Q9CWT3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Snx10Q9CWT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx10Q9CWT3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx10Q9CWT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx10Q9CWT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx10Q9CWT3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx10Q9CWT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snx10Q9CWT3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Snx10Q9CWT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snx10Q9CWT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snx10Q9CWT3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snx10Q9CWT3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx10Q9CWT3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Snx10Q9CWT3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx10Q9CWT3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snx10Q9CWT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snx10Q9CWT3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms