Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BccipQ9CWI3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BccipQ9CWI3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BccipQ9CWI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BccipQ9CWI3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BccipQ9CWI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BccipQ9CWI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BccipQ9CWI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BccipQ9CWI3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BccipQ9CWI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BccipQ9CWI3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BccipQ9CWI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BccipQ9CWI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BccipQ9CWI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BccipQ9CWI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms