Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Snw1Q9CSN1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snw1Q9CSN1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snw1Q9CSN1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snw1Q9CSN1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snw1Q9CSN1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snw1Q9CSN1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Snw1Q9CSN1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Snw1Q9CSN1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snw1Q9CSN1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snw1Q9CSN1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snw1Q9CSN1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snw1Q9CSN1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snw1Q9CSN1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Snw1Q9CSN1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Snw1Q9CSN1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snw1Q9CSN1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snw1Q9CSN1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snw1Q9CSN1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snw1Q9CSN1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms