Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prps2Q9CS42 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prps2Q9CS42 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prps2Q9CS42 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prps2Q9CS42 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prps2Q9CS42 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prps2Q9CS42 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prps2Q9CS42 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prps2Q9CS42 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prps2Q9CS42 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prps2Q9CS42 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms