Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CRC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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