Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CRC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CRC3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CRC3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q9CRC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CRC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CRC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CRC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CRC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q9CRC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9CRC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9CRC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms