Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS4

Slc25a46, Solute carrier family 25 member 46, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a46Q9CQS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc25a46Q9CQS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc25a46Q9CQS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc25a46Q9CQS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc25a46Q9CQS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc25a46Q9CQS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc25a46Q9CQS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc25a46Q9CQS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc25a46Q9CQS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc25a46Q9CQS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc25a46Q9CQS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc25a46Q9CQS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc25a46Q9CQS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a46Q9CQS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc25a46Q9CQS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc25a46Q9CQS4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms