Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ndufb9Q9CQJ8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ndufb9Q9CQJ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ndufb9Q9CQJ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ndufb9Q9CQJ8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Ndufb9Q9CQJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ndufb9Q9CQJ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ndufb9Q9CQJ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ndufb9Q9CQJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ndufb9Q9CQJ8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ndufb9Q9CQJ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ndufb9Q9CQJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ndufb9Q9CQJ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ndufb9Q9CQJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ndufb9Q9CQJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ndufb9Q9CQJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms