Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med30Q9CQI9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med30Q9CQI9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med30Q9CQI9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med30Q9CQI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med30Q9CQI9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Med30Q9CQI9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med30Q9CQI9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med30Q9CQI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms