Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asf1aQ9CQE6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asf1aQ9CQE6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Asf1aQ9CQE6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asf1aQ9CQE6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asf1aQ9CQE6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Asf1aQ9CQE6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asf1aQ9CQE6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Asf1aQ9CQE6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Asf1aQ9CQE6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Asf1aQ9CQE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Asf1aQ9CQE6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Asf1aQ9CQE6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Asf1aQ9CQE6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Asf1aQ9CQE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Asf1aQ9CQE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Asf1aQ9CQE6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms