Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mid1ip1Q9CQ20 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mid1ip1Q9CQ20 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mid1ip1Q9CQ20 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mid1ip1Q9CQ20 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mid1ip1Q9CQ20 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mid1ip1Q9CQ20 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mid1ip1Q9CQ20 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 432.6 ms