Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt88Q9CPR6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt88Q9CPR6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt88Q9CPR6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt88Q9CPR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt88Q9CPR6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt88Q9CPR6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt88Q9CPR6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt88Q9CPR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms