Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tsnaxip1Q99P25 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tsnaxip1Q99P25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tsnaxip1Q99P25 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Tsnaxip1Q99P25 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Tsnaxip1Q99P25 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Tsnaxip1Q99P25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Tsnaxip1Q99P25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,76
Tsnaxip1Q99P25 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Tsnaxip1Q99P25 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tsnaxip1Q99P25 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Tsnaxip1Q99P25 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tsnaxip1Q99P25 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Tsnaxip1Q99P25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Tsnaxip1Q99P25 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,1 ms