Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Acss1Q99NB1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Acss1Q99NB1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Acss1Q99NB1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Acss1Q99NB1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Acss1Q99NB1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Acss1Q99NB1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acss1Q99NB1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Acss1Q99NB1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Acss1Q99NB1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Acss1Q99NB1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Acss1Q99NB1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acss1Q99NB1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acss1Q99NB1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms